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1.246 +TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGT\n\
1.247 +TGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTC\n\
1.248 +TCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC\n\
1.249 +GGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGT\n\
1.250 +CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTAC\n\
1.251 +TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGA\n\
1.252 +GATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGG\n\
1.253 +GCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCT\n\
1.254 +GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAT\n\
1.255 +ACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG\n\
1.256 +GCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTG\n\
1.257 +CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCA\n\
1.258 +CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT\n\
1.259 +CGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC\n\
1.260 +GGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGC\n\
1.261 +TTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGG\n\
1.262 +GCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC\n\
1.263 +AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG\n\
1.264 +GCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCG\n\
1.265 +CGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAG\n\
1.266 +GCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAG\n\
1.267 +ACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG\n\
1.268 +GCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA\n\
1.269 +AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATC\n\
1.270 +CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAG\n\
1.271 +TGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAA\n\
1.272 +AAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCG\n\
1.273 +GATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA\n\
1.274 +CTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGG\n\
1.275 +AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCG\n\
1.276 +CGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCG\n\
1.277 +GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGT\n\
1.278 +CAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA\n\
1.279 +AATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGG\n\
1.280 +AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTC\n\
1.281 +CAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCT\n\
1.282 +GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGA\n\
1.283 +CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCG\n\
1.284 +TGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA\n\
1.285 +CCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC\n\
1.286 +AGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAC\n\
1.287 +TTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA\n\
1.288 +CATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGC\n\
1.289 +CTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGA\n\
1.290 +GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCC\n\
1.291 +GTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA\n\
1.292 +GGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC\n\
1.293 +CGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGC\n\
1.294 +TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC\n\
1.295 +CGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGC\n\
1.296 +CGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCA\n\
1.297 +CCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA\n\
1.298 +AATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCT\n\
1.299 +GAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCA\n\
1.300 +CTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGC\n\
1.301 +TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGA\n\
1.302 +GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA\n\
1.303 +GCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT\n\
1.304 +CGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC\n\
1.305 +TGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT\n\
1.306 +CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC\n\
1.307 +CTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG\n\
1.308 +GCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGG\n\
1.309 +GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC\n\
1.310 +GAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG\n\
1.311 +GAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGG\n\
1.312 +TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTA\n\
1.313 +ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTG\n\
1.314 +CAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTC\n\
1.315 +AAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGG\n\
1.316 +GCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT\n\
1.317 +CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTC\n\
1.318 +GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA\n\
1.319 +TCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGC\n\
1.320 +GCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGA\n\
1.321 +GGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAC\n\
1.322 +AAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC\n\
1.323 +AGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCA\n\
1.324 +CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACG\n\
1.325 +CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCG\n\
1.326 +AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGG\n\
1.327 +GCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT\n\
1.328 +GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC\n\
1.329 +GACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG\n\
1.330 +CACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC\n\
1.331 +CAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCG\n\
1.332 +CGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGC\n\
1.333 +GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC\n\
1.334 +TCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC\n\
1.335 +CGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAA\n\
1.336 +CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCC\n\
1.337 +AGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTG\n\
1.338 +AGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA\n\
1.339 +GGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGA\n\
1.340 +TCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACT\n\
1.341 +AAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG\n\
1.342 +GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCG\n\
1.343 +CCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGT\n\
1.344 +GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCA\n\
1.345 +GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA\n\
1.346 +TTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG\n\
1.347 +AATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCA\n\
1.348 +GCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGT\n\
1.349 +AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC\n\
1.350 +AGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTG\n\
1.351 +GTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC\n\
1.352 +CGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG\n\
1.353 +AGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT\n\
1.354 +TGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA\n\
1.355 +TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCT\n\
1.356 +GTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGG\n\
1.357 +TTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGT\n\
1.358 +CTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG\n\
1.359 +CGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCG\n\
1.360 +TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTA\n\
1.361 +CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCG\n\
1.362 +AGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCG\n\
1.363 +GGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACC\n\
1.364 +TGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA\n\
1.365 +TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA\n\
1.366 +GGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACT\n\
1.367 +GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTC\n\
1.368 +ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGT\n\
1.369 +TCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC\n\
1.370 +CGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG\n\
1.371 +CTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTG\n\
1.372 +GGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC\n\
1.373 +CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCT\n\
1.374 +GGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGC\n\
1.375 +GCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGA\n\
1.376 +GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGA\n\
1.377 +GACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA\n\
1.378 +GGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG\n\
1.379 +AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAAT\n\
1.380 +CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCA\n\
1.381 +GTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAA\n\
1.382 +AAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC\n\
1.383 +GGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCT\n\
1.384 +ACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGG\n\
1.385 +GAGGCTGAGGCAGGAGAATC\n\
1.386 +>TWO IUB ambiguity codes\n\
1.387 +cttBtatcatatgctaKggNcataaaSatgtaaaDcDRtBggDtctttataattcBgtcg\n\
1.388 +tactDtDagcctatttSVHtHttKtgtHMaSattgWaHKHttttagacatWatgtRgaaa\n\
1.389 +NtactMcSMtYtcMgRtacttctWBacgaaatatagScDtttgaagacacatagtVgYgt\n\
1.390 +cattHWtMMWcStgttaggKtSgaYaaccWStcgBttgcgaMttBYatcWtgacaYcaga\n\
1.391 +gtaBDtRacttttcWatMttDBcatWtatcttactaBgaYtcttgttttttttYaaScYa\n\
1.392 +HgtgttNtSatcMtcVaaaStccRcctDaataataStcYtRDSaMtDttgttSagtRRca\n\
1.393 +tttHatSttMtWgtcgtatSSagactYaaattcaMtWatttaSgYttaRgKaRtccactt\n\
1.394 +tattRggaMcDaWaWagttttgacatgttctacaaaRaatataataaMttcgDacgaSSt\n\
1.395 +acaStYRctVaNMtMgtaggcKatcttttattaaaaagVWaHKYagtttttatttaacct\n\
1.396 +tacgtVtcVaattVMBcttaMtttaStgacttagattWWacVtgWYagWVRctDattBYt\n\
1.397 +gtttaagaagattattgacVatMaacattVctgtBSgaVtgWWggaKHaatKWcBScSWa\n\
1.398 +accRVacacaaactaccScattRatatKVtactatatttHttaagtttSKtRtacaaagt\n\
1.399 +RDttcaaaaWgcacatWaDgtDKacgaacaattacaRNWaatHtttStgttattaaMtgt\n\
1.400 +tgDcgtMgcatBtgcttcgcgaDWgagctgcgaggggVtaaScNatttacttaatgacag\n\
1.401 +cccccacatYScaMgtaggtYaNgttctgaMaacNaMRaacaaacaKctacatagYWctg\n\
1.402 +ttWaaataaaataRattagHacacaagcgKatacBttRttaagtatttccgatctHSaat\n\
1.403 +actcNttMaagtattMtgRtgaMgcataatHcMtaBSaRattagttgatHtMttaaKagg\n\
1.404 +YtaaBataSaVatactWtataVWgKgttaaaacagtgcgRatatacatVtHRtVYataSa\n\
1.405 +KtWaStVcNKHKttactatccctcatgWHatWaRcttactaggatctataDtDHBttata\n\
1.406 +aaaHgtacVtagaYttYaKcctattcttcttaataNDaaggaaaDYgcggctaaWSctBa\n\
1.407 +aNtgctggMBaKctaMVKagBaactaWaDaMaccYVtNtaHtVWtKgRtcaaNtYaNacg\n\
1.408 +gtttNattgVtttctgtBaWgtaattcaagtcaVWtactNggattctttaYtaaagccgc\n\
1.409 +tcttagHVggaYtgtNcDaVagctctctKgacgtatagYcctRYHDtgBattDaaDgccK\n\
1.410 +tcHaaStttMcctagtattgcRgWBaVatHaaaataYtgtttagMDMRtaataaggatMt\n\
1.411 +ttctWgtNtgtgaaaaMaatatRtttMtDgHHtgtcattttcWattRSHcVagaagtacg\n\
1.412 +ggtaKVattKYagactNaatgtttgKMMgYNtcccgSKttctaStatatNVataYHgtNa\n\
1.413 +BKRgNacaactgatttcctttaNcgatttctctataScaHtataRagtcRVttacDSDtt\n\
1.414 +aRtSatacHgtSKacYagttMHtWataggatgactNtatSaNctataVtttRNKtgRacc\n\
1.415 +tttYtatgttactttttcctttaaacatacaHactMacacggtWataMtBVacRaSaatc\n\
1.416 +cgtaBVttccagccBcttaRKtgtgcctttttRtgtcagcRttKtaaacKtaaatctcac\n\
1.417 +aattgcaNtSBaaccgggttattaaBcKatDagttactcttcattVtttHaaggctKKga\n\
1.418 +tacatcBggScagtVcacattttgaHaDSgHatRMaHWggtatatRgccDttcgtatcga\n\
1.419 +aacaHtaagttaRatgaVacttagattVKtaaYttaaatcaNatccRttRRaMScNaaaD\n\
1.420 +gttVHWgtcHaaHgacVaWtgttScactaagSgttatcttagggDtaccagWattWtRtg\n\
1.421 +ttHWHacgattBtgVcaYatcggttgagKcWtKKcaVtgaYgWctgYggVctgtHgaNcV\n\
1.422 +taBtWaaYatcDRaaRtSctgaHaYRttagatMatgcatttNattaDttaattgttctaa\n\
1.423 +ccctcccctagaWBtttHtBccttagaVaatMcBHagaVcWcagBVttcBtaYMccagat\n\
1.424 +gaaaaHctctaacgttagNWRtcggattNatcRaNHttcagtKttttgWatWttcSaNgg\n\
1.425 +gaWtactKKMaacatKatacNattgctWtatctaVgagctatgtRaHtYcWcttagccaa\n\
1.426 +tYttWttaWSSttaHcaaaaagVacVgtaVaRMgattaVcDactttcHHggHRtgNcctt\n\
1.427 +tYatcatKgctcctctatVcaaaaKaaaagtatatctgMtWtaaaacaStttMtcgactt\n\
1.428 +taSatcgDataaactaaacaagtaaVctaggaSccaatMVtaaSKNVattttgHccatca\n\
1.429 +cBVctgcaVatVttRtactgtVcaattHgtaaattaaattttYtatattaaRSgYtgBag\n\
1.430 +aHSBDgtagcacRHtYcBgtcacttacactaYcgctWtattgSHtSatcataaatataHt\n\
1.431 +cgtYaaMNgBaatttaRgaMaatatttBtttaaaHHKaatctgatWatYaacttMctctt\n\
1.432 +ttVctagctDaaagtaVaKaKRtaacBgtatccaaccactHHaagaagaaggaNaaatBW\n\
1.433 +attccgStaMSaMatBttgcatgRSacgttVVtaaDMtcSgVatWcaSatcttttVatag\n\
1.434 +ttactttacgatcaccNtaDVgSRcgVcgtgaacgaNtaNatatagtHtMgtHcMtagaa\n\
1.435 +attBgtataRaaaacaYKgtRccYtatgaagtaataKgtaaMttgaaRVatgcagaKStc\n\
1.436 +tHNaaatctBBtcttaYaBWHgtVtgacagcaRcataWctcaBcYacYgatDgtDHccta\n\
1.437 +aagacYRcaggattHaYgtKtaatgcVcaataMYacccatatcacgWDBtgaatcBaata\n\
1.438 +cKcttRaRtgatgaBDacggtaattaaYtataStgVHDtDctgactcaaatKtacaatgc\n\
1.439 +gYatBtRaDatHaactgtttatatDttttaaaKVccYcaaccNcBcgHaaVcattHctcg\n\
1.440 +attaaatBtatgcaaaaatYMctSactHatacgaWacattacMBgHttcgaatVaaaaca\n\
1.441 +BatatVtctgaaaaWtctRacgBMaatSgRgtgtcgactatcRtattaScctaStagKga\n\
1.442 +DcWgtYtDDWKRgRtHatRtggtcgaHgggcgtattaMgtcagccaBggWVcWctVaaat\n\
1.443 +tcgNaatcKWagcNaHtgaaaSaaagctcYctttRVtaaaatNtataaccKtaRgtttaM\n\
1.444 +tgtKaBtRtNaggaSattHatatWactcagtgtactaKctatttgRYYatKatgtccgtR\n\
1.445 +tttttatttaatatVgKtttgtatgtNtataRatWYNgtRtHggtaaKaYtKSDcatcKg\n\
1.446 +taaYatcSRctaVtSMWtVtRWHatttagataDtVggacagVcgKWagBgatBtaaagNc\n\
1.447 +aRtagcataBggactaacacRctKgttaatcctHgDgttKHHagttgttaatgHBtatHc\n\
1.448 +DaagtVaBaRccctVgtgDtacRHSctaagagcggWYaBtSaKtHBtaaactYacgNKBa\n\
1.449 +VYgtaacttagtVttcttaatgtBtatMtMtttaattaatBWccatRtttcatagVgMMt\n\
1.450 +agctStKctaMactacDNYgKYHgaWcgaHgagattacVgtttgtRaSttaWaVgataat\n\
1.451 +gtgtYtaStattattMtNgWtgttKaccaatagNYttattcgtatHcWtctaaaNVYKKt\n\
1.452 +tWtggcDtcgaagtNcagatacgcattaagaccWctgcagcttggNSgaNcHggatgtVt\n\
1.453 +catNtRaaBNcHVagagaaBtaaSggDaatWaatRccaVgggStctDaacataKttKatt\n\
1.454 +tggacYtattcSatcttagcaatgaVBMcttDattctYaaRgatgcattttNgVHtKcYR\n\
1.455 +aatRKctgtaaacRatVSagctgtWacBtKVatctgttttKcgtctaaDcaagtatcSat\n\
1.456 +aWVgcKKataWaYttcccSaatgaaaacccWgcRctWatNcWtBRttYaattataaNgac\n\
1.457 +acaatagtttVNtataNaYtaatRaVWKtBatKagtaatataDaNaaaaataMtaagaaS\n\
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1.638 +tSaaatDgataaacttaHgttgVBtcttVttHgDacgaKatgtatatNYataactctSat\n\
1.639 +atatattgcHRRYttStggaactHgttttYtttaWtatMcttttctatctDtagVHYgMR\n\
1.640 +BgtHttcctaatYRttKtaagatggaVRataKDctaMtKBNtMtHNtWtttYcVtattMc\n\
1.641 +gRaacMcctNSctcatttaaagDcaHtYccSgatgcaatYaaaaDcttcgtaWtaattct\n\
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1.644 +taagtNacatHgttcRgacKcBBtVgatKttcgaBaatactDRgtRtgaNacWtcacYtt\n\
1.645 +aaKcgttctHaKttaNaMgWgWaggtctRgaKgWttSttBtDcNtgtttacaaatYcDRt\n\
1.646 +gVtgcctattcNtctaaaDMNttttNtggctgagaVctDaacVtWccaagtaacacaNct\n\
1.647 +gaScattccDHcVBatcgatgtMtaatBgHaatDctMYgagaatgYWKcctaatNaStHa\n\
1.648 +aaKccgHgcgtYaaYtattgtStgtgcaaRtattaKatattagaWVtcaMtBagttatta\n\
1.649 +gNaWHcVgcaattttDcMtgtaRHVYtHtctgtaaaaHVtMKacatcgNaatttMatatg\n\
1.650 +ttgttactagWYtaRacgataKagYNKcattataNaRtgaacKaYgcaaYYacaNccHat\n\
1.651 +MatDcNgtHttRaWttagaaDcaaaaaatagggtKDtStaDaRtaVtHWKNtgtattVct\n\
1.652 +SVgRgataDaRaWataBgaagaaKtaataaYgDcaStaNgtaDaaggtattHaRaWMYaY\n\
1.653 +aWtggttHYgagVtgtgcttttcaaDKcagVcgttagacNaaWtagtaataDttctggtt\n\
1.654 +VcatcataaagtgKaaaNaMtaBBaattaatWaattgctHaVKaSgDaaVKaHtatatat\n\
1.655 +HatcatSBagNgHtatcHYMHgttDgtaHtBttWatcgtttaRaattgStKgSKNWKatc\n\
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1.808 +tagaMBRatgRcMcgttgaWHtcaVYgaatYtaatctttYttatRaWtctgBtDcgatNa\n\
1.809 +tcKaBaDgatgtaNatWKctccgatattaacattNaaacDatgBgttctgtDtaaaMggt\n\
1.810 +gaBaSHataacgccSctaBtttaRBtcNHcDatcDcctagagtcRtaBgWttDRVHagat\n\
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1.832 +atVtccRaHtaSacataHattgtttKVYattcataVaattWtcgtgMttcttKtgtctaa\n\
1.833 +cVtatctatatBRataactcgKatStatattcatHHRttKtccaacgtgggtgRgtgaMt\n\
1.834 +attattggctatcgtgacMtRcBDtcttgtactaatRHttttaagatcgVMDStattatY\n\
1.835 +BtttDttgtBtNttgRcMtYtgBacHaWaBaatDKctaagtgaaactaatgRaaKgatcc\n\
1.836 +aagNaaaatattaggWNtaagtatacttttKcgtcggSYtcttgRctataYcttatataa\n\
1.837 +agtatattaatttataVaacacaDHatctatttttKYVatHRactttaBHccaWagtact\n\
1.838 +BtcacgaVgcgttRtttttttSVgtSagtBaaattctgaHgactcttgMcattttagVta\n\
1.839 +agaattHctHtcaDaaNtaacRggWatagttcgtSttgaDatcNgNagctagDgatcNtt\n\
1.840 +KgttgtaDtctttRaaYStRatDtgMggactSttaDtagSaVtBDttgtDgccatcacaM\n\
1.841 +attaaaMtNacaVcgSWcVaaDatcaHaatgaattaMtatccVtctBtaattgtWattat\n\
1.842 +BRcWcaatgNNtactWYtDaKttaaatcactcagtRaaRgatggtKgcgccaaHgaggat\n\
1.843 +StattYcaNMtcaBttacttatgagDaNtaMgaaWtgtttcttctaHtMNgttatctaWW\n\
1.844 +atMtBtaaatagDVatgtBYtatcggcttaagacMRtaHScgatatYgRDtcattatSDa\n\
1.845 +HggaaataNgaWSRRaaaBaatagBattaDctttgHWNttacaataaaaaaatacggttt\n\
1.846 +gHgVtaHtWMttNtBtctagtMcgKMgHgYtataHaNagWtcaacYattaataYRgtaWK\n\
1.847 +gaBctataaccgatttaHaNBRaRaMtccggtNgacMtctcatttgcaattcWgMactta\n\
1.848 +caaDaaNtactWatVtttagccttMaatcagVaagtctVaaDaBtattaattaYtNaYtg\n\
1.849 +gattaKtaKctYaMtattYgatattataatKtVgDcttatatNBtcgttgtStttttMag\n\
1.850 +aggttaHYSttcKgtcKtDNtataagttataagSgttatDtRttattgttttSNggRtca\n\
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1.852 +HtgYggaDgaYaKagWagctatagacgaaHgtWaNgacttHRatVaWacKYtgRVNgVcS\n\
1.853 +gRWctacatcKSactctgWYtBggtataagcttNRttVtgRcaWaaatDMatYattaact\n\
1.854 +ttcgaagRatSctgccttgcRKaccHtttSNVagtagHagBagttagaccaRtataBcca\n\
1.855 +taatSHatRtcHagacBWatagcaMtacaRtgtgaaBatctKRtScttccaNaatcNgta\n\
1.856 +atatWtcaMgactctBtWtaaNactHaaaaRctcgcatggctMcaaNtcagaaaaacaca\n\
1.857 +gtggggWttRttagtaagaVctVMtcgaatcttcMaaaHcaHBttcgattatgtcaDagc\n\
1.858 +YRtBtYcgacMgtDcagcgaNgttaataatagcagKYYtcgtaBtYctMaRtaRtDagaa\n\
1.859 +aacacatgYaBttgattattcgaaNttBctSataaMataWRgaHtttccgtDgaYtatgg\n\
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1.861 +tttccSagatgttccacgaggYNttHRacgattcDatatDcataaaatBBttatcgaHtN\n\
1.862 +HaaatatDNaggctgaNcaaggagttBttMgRagVatBcRtaWgatgBtSgaKtcgHttt\n\
1.863 +gaatcaaDaHttcSBgHcagtVaaSttDcagccgttNBtgttHagYtattctttRWaaVt\n\
1.864 +SttcatatKaaRaaaNacaVtVctMtSDtDtRHRcgtaatgctcttaaatSacacaatcg\n\
1.865 +HattcaWcttaaaatHaaatcNctWttaNMcMtaKctVtcctaagYgatgatcYaaaRac\n\
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1.873 +aagacgctDHYYatggttcaagccNctccttcMctttagacBtaaWtaWVHggaaaaNat\n\
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1.876 +actMtacataaattgRataatacgBtKtaataattRgtatDagDtcRDacctatRcagag\n\
1.877 +cSHatNtcaScNtttggacNtaaggaccgtgKNttgttNcttgaaRgYgRtNtcagttBc\n\
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1.879 +tHgaaMtHcagaaSatggtatgccaHBtYtcNattWtgtNgctttaggtttgtWatNtgH\n\
1.880 +tgcDttactttttttgcNtactKtWRaVcttcatagtgSNKaNccgaataaBttataata\n\
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1.887 +>THREE Homo sapiens frequency\n\
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1.1056 +aaagtcgtgtcgctttcgatgagagggaattcaccggaaaacaccttggttaacaggata\n\
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1.1069 +gacaatgtatcttttcctaaattgccatgtgcagatttctgagtgtcacgaagcgcataa\n\
1.1070 +tagaatcttgtgttgcctcaactcgttgaaaagtttaaaacaatcgcagcagtctttttg\n\
1.1071 +gggtctactgtgtgtttgcaaaataactgaaagaaacgcttgaacaactctgaagtagct\n\
1.1072 +cgagtactcattaaagtgtaacacattagtgaatatcggccaatgaaccaaacgcttccc\n\
1.1073 +ggtacgctatctctctcatcgggaggcgatgtgcaggttatctacgaaagcatcccttta\n\
1.1074 +cgttgagagtgtcgatgcatgaacctcattgtaacaatagcccagcaaattctcatacgt\n\
1.1075 +gcctcagggtccgggcgtactcctccatggaagggcgcgcatctagtgttataccaactc\n\
1.1076 +gctttttaactactatgctgtagttctacaggcatagtggccagtattttctaacttctc\n\
1.1077 +tggatagatgctctcactcctcatccatcacggcttcagtttacgtcttacttgcttgtt\n\
1.1078 +cagcaacggatggaggcattaagtatcttcactgttccctaaaattgctgttcaatatca\n\
1.1079 +aagtaaggacgatacagggaaagctcaagcacactcattgaatactgccccagttgcaac\n\
1.1080 +ctcacttaatctgacaaaaataatgactactctaagtgttgcggaagcagtctcttccac\n\
1.1081 +gagcttgtctgtatcacttcgtataggcatgtaactcgatagacacgaacaccgagtgag\n\
1.1082 +aaactatattcttgcttccgtgtgtgtgacaccaggtaattgatgcggatataagctgga\n\
1.1083 +gatcactcacgcccacacaaggcgctgctacctctttattccaatgtgtaagaatttgct\n\
1.1084 +aacttcatttctagaccgcagctttgcggtcataatttcacggtacggacccttgggtta\n\
1.1085 +gagacttgataacacacttcgcagtttccaccgcgcacatgttttagtggcttctaacat\n\
1.1086 +agaatttttgttgtgacataaagagtgcgtgggagacttgcccgaccgttaagccataat\n\
1.1087 +caattgaaagccccgtgagtcacatctaattggttgtactgcgcatttagctatccttta\n\
1.1088 +gctgactcgaagagattcgattcctaatataggttaattagatggctgccgcgcgaagta\n\
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1.1090 +tccaagttcgctacgttatgagagagattggaattaagcaaatatgttttatggtgattt\n\
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1.1111 +tactctttttttcctagggtattgtagaggccagtggacaaaataaatcaaatttaagat\n\
1.1112 +gtttcggacattaacatcccccgtagcatagaaatcatcagttatccaatctctcatcga\n\
1.1113 +gcttttacaatttctgctggcgctatggacagcatatgccgcgagacctccgcaagactc\n\
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1.1116 +gttatttttgaacaatgggttgtattcaattttatatcacgaatggaacccttcattccc\n\
1.1117 +ggcataatactagacgacacgaacaagctccgatctatcagccaggcacgtgttaaggtt\n\
1.1118 +taattccggcaaaccaatgaagcatcaaaaggtgacctgatgcaacttagggtcacgatg\n\
1.1119 +agtttttcaggactacttattacctattaataagttaacatgagccttcataccccgtaa\n\
1.1120 +gacaatacatactccaccaattagaattctgagccatcttatctttttgtatcatcgaag\n\
1.1121 +ggtatggccgaataggttaattagttactcctaacgtctctacaggcatgcatttgacgc\n\
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1.1124 +taatacagaaggaaggggcatcttcgaatacggatgaataattctatctgtttattctga\n\
1.1125 +catcttgttttcaggttaatcttacgcattcaaatgacgcctgccccatgcgtgcgcaat\n\
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1.1210 +aacccactttcggttctaatagtagttaacgacacaacgaataacctttactgtggggct\n\
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1.1230 +gtaattctaggcataaaactccagcaatttgggggccgaaaacaaatgacgttagctaat\n\
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1.1235 +ttttatgaagtcgtcgagacgcagttcctattgatttattctaaacggagatgtgcttcg\n\
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1.1241 +ccggtgttaaacacatattattattgttatccaactaatcggacctatgcataaagcatt\n\
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1.1245 +tatagttgaaatggtattcagctagtgacgtgtaccaattatcatagttcactcaagcaa\n\
1.1246 +gacgctcattaacgaatatagacaagacactatatcatataataaaaaagaacatggtgc\n\
1.1247 +tcgaacatagttgaattcaccatattgaaggggaatgctgacatgtaattcgctactaga\n\
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1.1250 +tctcttacctttcttgcttatgataaacgacggtccctgtacatcactgggaattctcag\n\
1.1251 +caaaaataattgggtaaatcgagactcgatgtattcggccacaaaggtgttagacgttaa\n\
1.1252 +agattattcaacggggcgataataggatcataaccggtatgcaagcgcattgaaagagcc\n\
1.1253 +atgagatccttatccgataaacgctgcacggtatgtgcagccttattgtcgatcacgaat\n\
1.1254 +ttataaatgtagtctgggctgtaagttgaagacctaagttataatgaagtgcaataccaa\n\
1.1255 +atcgattcatagtggattatcagactcaagatatctcctgataaattacagttgttaaga\n\
1.1256 +tacggataaaatgagatttaagattagcagcctctaatctgtttcaatcccgttggaatg\n\
1.1257 +tggtatgcgatcaaggttaagttaaaatcaagcctgtcttcagtcttgattcttgttctg\n\
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1.1259 +agtatagattcgtagaggaatattatcaagcttccacgcctcaacgtacgtgtattggtc\n\
1.1260 +acacaagacactaaaagtggaagtagcgtaaactatagtctagttgttaaatgctcagtt\n\
1.1261 +cttgttatattcgatatactcttggctaatttatgtctgagtatataaaattaatgatat\n\
1.1262 +taacttgcatttcacggatcccttagaaaaagattttgaccgagcgcattataaacggtt\n\
1.1263 +acaccgaatcaatagaagcatacccaatagctttctttgaatttattgcctgcgcaactt\n\
1.1264 +ggctgactctctagatccgaataattctatatggtcgtgacgaaactagttcattactgt\n\
1.1265 +ttaaaatgccaacatgtcttttgggccgataatggctctttgcaaaattactcaatgata\n\
1.1266 +cgattgatcaaagcggtagttgctagtggtagcatgtaagtctatcaaatgtctgattat\n\
1.1267 +ccgaaaatcttccaaaagagtccacgtaccatatctatctcatagcgacgcgaggggaac\n\
1.1268 +cttatctaactatcattccatttaccgggtgactctcgatgcaggatccgattgggataa\n\
1.1269 +attgcccagaaatggctcattcctgactaagggtaaggccgttctcagcaagggaacccc\n\
1.1270 +gcgaatctaggcttataccatctagattgttaactacttgcctgtagttctacagccata\n\
1.1271 +ctggacagttgtttctaaatgatcgggattcatgctagcactcctctgaatgcaccgcgt\n\
1.1272 +aagtttaactattacgtccgtgggcagataaggatggaggctgtatgtatcttaactgtt\n\
1.1273 +acctaatatggctggtaattatcaaagtaaggaccttaatgccatagcgctagcaatcgc\n\
1.1274 +tttgtatactgaccatgtgccaacctctcttaatctgtaaaatataatgtcttagctaac\n\
1.1275 +tgtggacgatcatgtctctgcctagagcttcgctgtatcaattcctatagccagcgtact\n\
1.1276 +agtgacacaacaacaccgtgtgagaaaagatattagtccttacgtctgtctctctacagc\n\
1.1277 +ttattgatgaggattgaacatggacatatagctccccctcaaaagcagatgctacctctt\n\
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1.1479 +aagggatctcacacatgccttggaacatttttgctttgtgccgctttttcgctgcactac\n\
1.1480 +caatccttacttaccagtatattcaaaggtcgttaacagaatgagaaaggttagggctct\n\
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1.1495 +gaaaattttttctagttcatctgataatttgccaattcaaaaacaaccgctggtttcccg\n\
1.1496 +gcgcattctctaaaatggaagtcgaacctagagccattatttgtcggtaacccatgagtt\n\
1.1497 +ccttcttttcagaagttaatacactgtggtcctatacagaggaaaaacagcggttatata\n\
1.1498 +cgatcgtggcataacaacattggatcaagatagcaatttggctacctattctaattctca\n\
1.1499 +ctagattcggtattccactacaatatcggcagattaggattggatgaataatcggtgttt\n\
1.1500 +aagtccggttgcgtctccaatctcctaatttttattaatattgatcttggtgacctattg\n\
1.1501 +taaataaaaacttcaagactttgaataacggtgaaaagatagaagactcatttgaaaatg\n\
1.1502 +gatcatccacagatccaaacattagcaagacactaatccccaactagctattctgatcgc\n\
1.1503 +gatcgtgctgcagtactcctgtcacaatagtctgttcatgatctaattctttttgggctt\n\
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1.1513 +taccgcatgaggacttgaaccatcttgtaggagttatgtttattagctaagattcgttta\n\
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1.1525 +atatatcgccgtgaatccagaagattgtcttctttggattatcaaccgagatcctgtgga\n\
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1.1529 +gtatacatcgaattcggggcatacactatagttgcattgtatttagctgctttaaataat\n\
1.1530 +atgatattaccttccttacataagacattaccggcataccctggttttcaacttgtgggg\n\
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1.1534 +tcatgattgcgcaagtaagaaaaaaaggcaaaaggatgcgcggaatagaaacttatcagt\n\
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1.1536 +aatgcaatacacagtaacccccacccttgattgtaatgtcgatttgaagttgtacgcgtc\n\
1.1537 +gacgaagtggatagtatacgggccttttgtacggtgcgatcaactatgaatctcggcgag\n\
1.1538 +ttagatggtcgtacaatctcacacatagaggtcacttgcctgtaatgacgaattttcggc\n\
1.1539 +taggtactcgaactttattagaagtaaaaatgtgggcaaaagaaggattccattttacaa\n\
1.1540 +gacgattacaatgagttacatgtctctcaacgtagtctttccctagtagtctttgaacta\n\
1.1541 +tttaggtactccagaaaattttagcaaagggtttctgtgtgaatccgccattcatgttta\n\
1.1542 +tgatggaacaataagaataacgccctcgtatgttatcgacagtgaagtcagcagttcggc\n\
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1.1544 +ctaaacggttatcaaagtaggtctaattactatactaacgggtgcatcgtaataactgct\n\
1.1545 +gtcgatgcaacactatatgatagtgtcgttttgctatatatgtacaatgtgacaaagaag\n\
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1.1551 +aaacttcatgagaactttagctggcttttggccagtatttagggaccaagagcactagcc\n\
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1.1567 +cccgtacaaacataagaagtcataatcttacttgaaattaattttgccttttattttttt\n\
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1.1677 +ttctttcctatcctagtgctaaaaatcatacttgcaatcccatagcacggattaagaacc\n\
1.1678 +taagaaacaattcagtaaaacatgttcgaattcttggtatgggaacatcattgcagctat\n\
1.1679 +ggtctaacgcattaatgtttgggtacatcttccatcatataaacaggaagagtctgacga\n\
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1.1685 +tatggttttcaaacagtctcaggatattgtatatacagataatccgataccagttgtctg\n\
1.1686 +acgcccctcttacgtaccccaccctttgtgacgtttaaagcagttgttcagtattttaaa\n\
1.1687 +ctaggcggcaactaatttggaaagaagcacagtggatatgtctaaattcttgttattcag\n\
1.1688 +gcctgaatttaatacaccgcatagttaacttcgcggtagagttgttcatcatgcctcctc\n\
1.1689 +taagctaccacttctatgatacaccaatagttgttctacggaatctgataattggccaag\n\
1.1690 +tcataaacttccgctgcgttcaacccccttgctcgaatatccaactcgaaaagacagcct\n\
1.1691 +tttggtgtccggaacaaatcagttacttcttttctgatgttaattctctgtggtcagata\n\
1.1692 +cagaccaaaaactccgcggatttaccatcctccaagaacaaatttgcatcaacatagcat\n\
1.1693 +tttggctacatattctaagtctcaatagtttaggttttcaactacattatcccaacatta\n\
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1.1695 +aatatgcttctgccgcacctatggttattaaaaaagtcatgactttgaagaaccctgaaa\n\
1.1696 +agatagatgaatcaggtgtaatggcagcagccaaagagcatataattagcaacactctaa\n\
1.1697 +gaacattatagatatgatgatagcgatcgtcatgatgttatccggtcacaatagtagctt\n\
1.1698 +catcagctaattcgttttgccagtggtgacttgcgctggaagaatcgttatacggtccct\n\
1.1699 +tccctcttgatacggtgggggcttattcaaccgcgtggattgggttgtcatacttgcatt\n\
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1.1706 +gaattttttgtcgaaaaactcgaacctggtaatttaaaccatatatctttatgtcgtcaa\n\
1.1707 +taactctcatatgttttatataacttcccaatcacgacttgtaactgcttgttcgactga\n\
1.1708 +gctgtttgagctatgaggccgggatccggttgagctacatctatttgctacaagaaaaat\n\
1.1709 +gaaagcacatttgttgggagttctggctacactcatagagaaataagtggcccgagtggg\n\
1.1710 +tgcggcctgcctccatattcaagtgtatcttaaaccaagtggttccaacgctcgcgctaa\n\
1.1711 +agaattaaagcctttatttcctccacggagtagcccgtaatccggttcgaaagagaccat\n\
1.1712 +tgaagttaattttcatatccagtgaagtttaggcacaagcatgtgttctgccacatgcct\n\
1.1713 +caaagcgctcttcaaccaagatatgattcatcctaacttcgatgaatgcgtctgtaacat\n\
1.1714 +aaatatagaaggaatgattcggcgagttaattttcgccttctccaacatggcatccctac\n\
1.1715 +gttcgttataaggaccatacatgtaggttttaaaggtttgcggttaatcgatatttacat\n\
1.1716 +catagaaattctatagtcaaatttacaagactctagatactcactcgttgcagccggcta\n\
1.1717 +ggaagcgctttgtaccttacttcccttttcgttgcgtaatatgaatttcatatagtaagt\n\
1.1718 +tcaaggcactcatacctccgtgaagagggtagatagactattaaagttgtttaatagtac\n\
1.1719 +gtattgatggaaatgacccgtaggagatttaccactcaatccacaagattcgctgctgtg\n\
1.1720 +cattatcaaaacagtgcatgtcgaaacatgggttgggtccttcaaacacgaatccaggta\n\
1.1721 +gagatacctttgcaattttt\n";
1.1722 +
1.1723 +dnaInput = dnaInput + dnaInput + dnaInput;
1.1724 +
1.1725 +var ilen, clen,
1.1726 + seqs = [
1.1727 + /agggtaaa|tttaccct/ig,
1.1728 + /[cgt]gggtaaa|tttaccc[acg]/ig,
1.1729 + /a[act]ggtaaa|tttacc[agt]t/ig,
1.1730 + /ag[act]gtaaa|tttac[agt]ct/ig,
1.1731 + /agg[act]taaa|ttta[agt]cct/ig,
1.1732 + /aggg[acg]aaa|ttt[cgt]ccct/ig,
1.1733 + /agggt[cgt]aa|tt[acg]accct/ig,
1.1734 + /agggta[cgt]a|t[acg]taccct/ig,
1.1735 + /agggtaa[cgt]|[acg]ttaccct/ig],
1.1736 + subs = {
1.1737 + B: '(c|g|t)', D: '(a|g|t)', H: '(a|c|t)', K: '(g|t)',
1.1738 + M: '(a|c)', N: '(a|c|g|t)', R: '(a|g)', S: '(c|t)',
1.1739 + V: '(a|c|g)', W: '(a|t)', Y: '(c|t)' }
1.1740 +
1.1741 +ilen = dnaInput.length;
1.1742 +
1.1743 +// There is no in-place substitution
1.1744 +dnaInput = dnaInput.replace(/>.*\n|\n/g,"")
1.1745 +clen = dnaInput.length
1.1746 +
1.1747 +var dnaOutputString;
1.1748 +
1.1749 +for(i in seqs)
1.1750 + dnaOutputString += seqs[i].source + " " + (dnaInput.match(seqs[i]) || []).length + "\n";
1.1751 + // match returns null if no matches, so replace with empty
1.1752 +
1.1753 +for(k in subs)
1.1754 + dnaInput = dnaInput.replace(k, subs[k], "g")
1.1755 + // search string, replacement string, flags
1.1756 +
1.1757 +
1.1758 +var _sunSpiderInterval = new Date() - _sunSpiderStartDate;
1.1759 +
1.1760 +document.getElementById("console").innerHTML = _sunSpiderInterval;
1.1761 +</script>
1.1762 +
1.1763 +
1.1764 +</body>
1.1765 +</html>
